Pusat Kajian Sains Islam merupakan pusat studi yang didirikan untuk mengkaji dan mengembangkan kajian terintegrasi antara islam dan sains. Dalam sains islam, referensi utama atau data primer sains islam diperoleh dari teks-teks Al-Quran dan hadits nabi. Fakta-fakta ilmiah dalam islam adalah informasi yang berasal dari keduanya. Fakta-fakta ilmiah ini kemudian diperkuat oleh penelitian dan penemuan ilmiah. Pusat Kajian Sains Islam dapat menjadi kekuatan strategis bagi STIT Nurussalam dalam pengembangan tradisi intelektual islam dengan mewujudkan struktur keilmuan yang berorientasi pada integrasi islam dan sains.
Program kerja Pusat Kajian Sains Islam berorientasi pada kegiatan pendidikan dan pelatihan peningkatan kompetensi SDM terkait kajian integrasi islam, sains dan teknologi
a. Orientasi Program Bidang Penelitian dan publikasi ilmiah
Melakukan dan mengembangkan penelitian dan publikasi ilmiah di bidang integrasi sains teknologi dan islam
Melakukan kerjasama penelitian di bidang integrasi sains teknologi dan islam baik secara nasional maupun internasional
b. Orientasi Program Bidang Pengabdian Masyarakat
Melakukan dan mengembangkan pengabdian masyarakat di bidang integrasi sains teknologi dan islam
Melakukan kerjasama pengabdian masyarakat di bidang integrasi sains teknologi dan islam baik secara nasional maupun internasional
c. Orientasi Program Bidang Pendidikan dan Pelatihan
Melakukan dan mengembangkan pendidikan dan pelatihan di bidang integrasi sains teknologi dan islam
Melakukan kerjasama bidang pendidikan dan pelatihan guna meningkatkan kompetensi SDM di bidang integrasi sains teknologi dan islam baik secara nasional maupun internasional